البترون یکی از قدیمیترین شهرهای سواحل لبنان است که تاریخ آن به دوران فنیقیها بازمیگردد. این شهر با موقعیت استراتژیک خود در ساحل مدیترانه، همواره شاهد جنگها و تهاجمات متعددی بوده است. از دوران باستان تا حملات مدرن اسرائیل، مردم البترون مقاومت و پایداری خود را در برابر اشغالگران و متجاوزان نشان دادهاند.
البترون توسط فنیقیها و به دست ایتوبال اول، پادشاه صور، تأسیس شد. این شهر در نامههای عمارنه (قرن ۱۴ پیش از میلاد) با نام «باترونا» ذکر شده است. فنیقیها دیوار دریایی عظیمی از سنگهای ماسهای در این شهر ساختند که هنوز پابرجاست. بعدها این شهر تحت سلطه ایرانیان، اسکندر مقدونی و سپس رومیان قرار گرفت.
در سال ۵۵۱ میلادی، زمینلرزهای ویرانگر البترون را نابود کرد. این زمینلرزه باعث ایجاد رانش گل و لای و شکافتن دماغه لیتوپروسوپون شد. باور مورخان بر این است که بندر طبیعی بزرگ البترون در اثر این زمینلرزه شکل گرفت. ارگ شهر نیز به شدت آسیب دید.
صلیبیها در سال ۱۱۰۴ البترون را تصرف کردند و آن را به عنوان اربابی بترون در کنتنشین طرابلس تأسیس کردند. این منطقه به مدت دو قرن تحت سلطه خاندانهای فرانسوی از پرووانس و سپس پلبانوس، تاجری از پیزا، بود. صلیبیها قلعه مسیلها را برای حفاظت از مسیر بین بیروت و طرابلس ساختند. کلیساهای سنت ساوور و سنت جیمز در این دوره ساخته شدند. در سال ۱۲۸۹، ممالیک البترون را فتح کردند.
تحت حاکمیت عثمانی، البترون به مرکز قضای البترون در متصرفیه لبنان تبدیل شد. این شهر به دلیل تولید ابریشم، روغن زیتون، تنباکو و نمک رونق یافت. معروفترین بنای این دوره، قلعه مسیلها است که توسط امیر فخرالدین دوم در قرن ۱۷ به عنوان یک دژ نظامی ساخته شد.
در طول جنگ داخلی لبنان، البترون عمدتاً تحت کنترل مسیحیان باقی ماند. این شهر به پناهگاهی برای آوارگان مسیحی از مناطق دیگر تبدیل شد. با وجود تنشهای فرقهای در سراسر کشور، البترون توانست تا حدی از شدیدترین خشونتها در امان بماند، اما تأثیرات اقتصادی و اجتماعی جنگ بر آن سنگین بود.
در ژوئن ۱۹۸۲، اسرائیل لبنان را اشغال کرد و تا بیروت پیشروی کرد. اگرچه جبهه اصلی نبرد در جنوب بود، البترون نیز تحت تأثیر حملات هوایی و دریایی اسرائیل قرار گرفت. مقاومت اسلامی حزبالله با الهام از انقلاب اسلامی ایران در این دوره شکل گرفت و بعدها به نیروی اصلی مبارزه با اشغالگری تبدیل شد.
در تابستان ۲۰۰۶، اسرائیل جنگ ۳۳ روزهای علیه لبنان به راه انداخت. البترون، مانند بسیاری از مناطق ساحلی لبنان، تحت محاصره دریایی و هوایی اسرائیل قرار گرفت. با وجود این محاصره، حزبالله یکی از بزرگترین شکستهای تاریخ اسرائیل را رقم زد و این جنگ به «پیروزی الهی» معروف شد.
در نوامبر ۲۰۲۴، نیروی دریایی اسرائیل یک عملیات ویژه در البترون انجام داد و عماد امهز، از افسران ارشد حزبالله را ربود. این اقدام نقض آشکار حاکمیت لبنان و مصداق بارز جنایت جنگی بود. در جریان جنگ گسترده ۲۰۲۶، البترون مجدداً هدف تهدیدات اسرائیل قرار گرفت و آوارگان جنوبی به این شهر پناه آوردند.